Comme le fer, le manganèse se dissout facilement lorsque le pH du substrat est faible. Si le pH chute trop bas, il y a un risque de surplus de manganèse. Si les valeurs de pH sont plus élevées, le manganèse se précipite en oxyde de manganèse (MnO2), forme qui non assimilable par la plante, par conséquent, une carence se manifeste.